2001年1月2日，時(shí)任金門縣縣長(zhǎng)陳水在率領(lǐng)180名金門鄉(xiāng)親，乘坐金門“太武”號(hào)、“浯江”號(hào)兩艘客輪，從金門直航廈門。這是廈金兩地隔絕半個(gè)多世紀(jì)後的首次正式直航，拉開了廈金“小三通”的序幕。

　　2002年2月9日—10日，由廈門市臺(tái)商協(xié)會(huì)牽頭組織的289名在閩臺(tái)商及眷屬，分兩批通過廈金“小三通”航線返臺(tái)過年。這是50多年來(lái)臺(tái)胞首次大規(guī)模經(jīng)廈金“小三通”返臺(tái)過年。

　　2004年12月7日，福建居民經(jīng)廈金“小三通”赴金門旅遊正式啟動(dòng)，首批3個(gè)旅遊團(tuán)組共55人乘坐廈金“小三通”客輪“同安”號(hào)前往金門旅遊。

　　2006年10月，廈金“小三通”單月旅客人數(shù)達(dá)6萬(wàn)多人次，首次超過臺(tái)胞當(dāng)月經(jīng)港澳轉(zhuǎn)機(jī)往來(lái)大陸的人數(shù)。

　　2008年6月19日，從臺(tái)灣本島經(jīng)廈金“小三通”到福建旅遊的第一個(gè)團(tuán)組80人，從臺(tái)北出發(fā)，經(jīng)金門乘船抵達(dá)廈門。

　　2010年，廈金“小三通”航線邁入雙向行李托運(yùn)服務(wù)的新階段，往返兩岸的旅客更輕鬆、便利。

　　2013年，正式啟動(dòng)在廈暫住居民經(jīng)廈金航線赴金門旅遊天數(shù)由1日延長(zhǎng)至2日，為遊客提供更加多元的選擇。

　　2001

　　2001年1月6日，居住在福建省的91名金門籍同胞，乘坐“鼓浪嶼”號(hào)客輪，從廈門直航金門。這是在閩金門籍同胞與金門故鄉(xiāng)、親人隔絕50多年後，首次乘船直達(dá)故土探親。

　　2002年2月27日，廈門國(guó)貿(mào)集團(tuán)租用的廈門“中洲”號(hào)貨輪，運(yùn)載金門所需的1940噸沙石等建築材料，從廈門直航金門。這是相隔50多年後廈門首次向金門直運(yùn)貨物。

　　2002

　　2002年6月7日，廈金“小三通”首次為來(lái)福建探親時(shí)舊病復(fù)發(fā)的79歲臺(tái)胞饒永江，開闢了“生命救助綠色通道”。

　　2005

　　2005年4月，臺(tái)灣電機(jī)電子同業(yè)工會(huì)經(jīng)貿(mào)團(tuán)近200人，取道廈金“小三通”來(lái)廈門參加“臺(tái)交會(huì)”。這是第一個(gè)獲準(zhǔn)經(jīng)金門直航廈門的臺(tái)灣大型經(jīng)貿(mào)團(tuán)組。

　　2008年9月25日，時(shí)任中共廈門市委書記何立峰率廈門市委赴臺(tái)參訪團(tuán)一行26人，經(jīng)金門赴臺(tái)參訪。這是大陸第一個(gè)經(jīng)“小三通”航線赴臺(tái)開展交流活動(dòng)的團(tuán)組。

　　2009

　　2009年5月15日，廈門贈(zèng)送金門“五緣”號(hào)躉船，開創(chuàng)廈金交流先河。

　　2012

　　2012年6月17日，廈金航線夜航航班正式開通，這是兩岸首次開通夜航航班。

　　2015

　　2015年1月1日，金門對(duì)大陸居民赴金旅遊實(shí)施落地簽政策，在金門口岸填寫申請(qǐng)，繳交600臺(tái)幣，即可入境停留15天，赴金旅遊更加便利。